La organización de los Juegos Olímpicos y Paralímpicos involucra a varias instituciones. El Comité Organizador de Tokio 2020 será responsable de la construcción de todas las sedes temporales.
El Centro Acuático Olímpico, el Ariake Arena, el Canal Sea Forest, el canal de piragüismo en eslalon, el Campo de Tiro con Arco de Dream Island y el Musashino Forest Sports Plaza, todas ellas sedes permanentes, serán construidas por el Gobierno Metropolitano de Tokio.
Por último, el nuevo Estadio Nacional, que también es una sede permanente, será construido por el Consejo de Deportes de Japón.